باکتری کلامیدیا تراکوماتیس یکی از بیماریهای گرم منفی و بیماریزای انسانی است که از راه جنسی منتقل می شود (Sexually Transmitted Disease) (STD) و به دورن سلولها می رود و پس از آسیب به سلول، آن را پاره می کند و  به سلول دیگر می رود و می تواند مدتی در سلول بماند بدون اینکه علامتی در فرد ایجا کند که به آن دوره کمون می گویند و بین 1 تا 5 هفته به طول می انجامد.

هنگامی که باکتری سلول را پاره می کند اجسام عفونی تولید می کند که باعث بروعلائم در فرد می شود که در خانمها به شکل سوزش ادرار و ترشح واژینال و نامرتبی قاعدگی و درد در حین مقاربت و درد و ترشحات در مجاری ادراری می باشد.

از آنجایی که بروز این بیماری بیشتر در افراد جوان و فعال از نظر جنسی به وجود می آید، تشخیص به موقع آن امری مهم در درمان می باشد.
تشخیص به روشهای گوناگونی صورت می گیرد از جمله کشت، سرولوژی، روش مولکولی، بررسی مستقیم:

کشت:

پس از نمونه برداری از بافت آن را به روشهایی چون گیمسا رنگ آمیزی می کنند و زیر میکروسکوپ مشاهده می کنند که طی آن می توان اجسام داخل سلولی را که در مراحل اولیه بیماری به وجوود می آیند مشاهده کرد.

کشت سلولی:

مقداری از ذرات و سلولها را به تخم مرغ جنین دار یا محیط کشت سلولی می برند و در آنجا سلولها را رشد می دهند و میزان تخریب سلولها را درآنها مشاهده می کنند.

سرولوژی:

در این روش به دلیل اینکه در افراد آلوده شده، در چشم و ترشحات چشمشان آنتی بادی اختصاصی علیه آنتی ژنها به وجود آمده می توان بیماری را تشحیص داد ولی این تست به دلیل اینکه تنها 2-4 هفته پس از شروع عفونت مثبت می شود، تست کاملی نیست.

روش مولکولی:

روش مولکولی همانطور که از نامش پیداست در حد مولکولهاست. بنابراین بسیار دقیق تر از روشهای دیگر می باشد. یکی از روش های مولکولی روش PCR  می باشد که مخفف polymerase chain reaction می باشد که در آن پس از نمونه برداری از باکتری استخراج DNA انجام می شود و با نتایج به دست آمده از آن و اندازه ژن آن، وجود یا عدم وجود این باکتری تشخیص داده می شود.

این تست کمی هزینه بر ولی بسیار دقیق است و برخی از آزمایشگاهها امکانات انجام آن را دارند.